Vào tháng 4,2005 diễn ra Lễ hội Star Wars Celebration III, Lucas nói rằng "Chúng tôi đang triển khai một dự án tiếp nối 3D của thí điểm trên Cartoon Network; có lẽ chúng tôi sẽ không bắt đầu dự án cho một năm nữa".[16] Vào tháng 7,2005 loạt phim bắt đầu đi vào giai đoạn tiền sản xuất. Sansweet coi loạt phim như "Thế hệ tiếp theo của loạt sử thi Star Wars, một loạt phim được cắt 30 phút, kĩ xảo máy tính 3D dựa trên sự kiện Chiến tranh vô tính xảy ra giữa Episode II... and Episode III." Sansweet miêu tả cái nhìn của loạt phim như " Một sự kết hợp giữa anime châu Á và kỉ xảo máy tính." Sản xuất được thực hiện ở xưởng Lucasfilm Animation ở Singapore.[17]

Theo như một tuyên bố khác của Sansweet, "Lucasfilm Animation sẽ thuê tổng cộng hơn 300 họa sĩ kĩ thuật số và một số khác ở cả California và Singapore đẻ không chỉ sản xuất loạt phim, mà còn các loạt phim khác trông tương lai". Ông nói về loạt phim, "để có được tiến triển về loạt phim, Lucasfilm Animation đã phải thuê nhà sản xuất chính và những tài năng sáng tạo để dẫn dắt dự án loạt phim đầu tiên." Sansweet đã nói rằng "một yếu tố lớn của tương lai Star Wars và Lucasfilm chính là kỉ xảo CGI".

Lucasfilm Ltd. và Lucasfilm Animation sử dụng phần mềm Autodesk để sản xuất loạt phim. Chương trình mô phỏng Maya 3D đã được sử dụng để tạo ra thế giới,loài vật và các nhân vật chi tiết.[18] Các họa sĩ cũng xem xét lại thiết kế từ loạt phim Star Wars: Clone Wars khi đang thiết kế hoạt hình cho phim và loạt phim mới.[19]

Vào tháng 3 năm 2007 Lucas có mặt ở 2007 PaleyFest,[20] Lucas đã hé lộ rằng loạt phim đang trong giai đoạn chuyển thành từng tập, một số tập sẽ không tập trung vào Anakin Skywalker; một số tập sẽ tập trung vào lính vô tính và các nhân vật khác. Lucas tiết lộ các chi tiết trong một buổi phỏng vấn với người hâm mộ[21], một nhân vật mới Ashoka Tano, hơn 100 tập phim và sự xuất hiện của Boba Fett. Trong một buổi phỏng vấn vào ngày 24 tháng 9 năm 2007, Lucas đã xác nhận 39 tập của loạt phim đã được hoàn thành[22].

Vào ngày 8, tháng 4 năm 2007, Ain't It Cool News thông báo rằng Eric Rigler đã thực hiện một bản nhạc cho loạt chương trình. Rigler nói rằng mỗi hành tinh trong Clone Wars phải có riêng nhạc dạo.

Mùa 6,7 và 8 vẫn đang được sản xuất dang dở trong thời gian chương trình bị hoãn vào tháng 3, năm 2013.[23]